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我的雙2080Ti有用武之地了!英偉達號召玩家捐GPU算力尋找新冠治療方法

2020-04-07 19:08:48 雷鋒網 劉琳 編輯:草根 瀏覽數:21草根網

近日,NVIDIA GeForce 官方推特發布公告稱:“ PC 玩家們,讓我們的 GPU 一起加入工作吧。加入我們,用閑置的 GPU 算力支持 [email protected] 項目,以對抗新冠病毒”。[email protected]

近日,NVIDIA GeForce 官方推特發布公告稱:“ PC 玩家們,讓我們的 GPU 一起加入工作吧。加入我們,用閑置的 GPU 算力支持 [email protected] 項目,以對抗新冠病毒”。

[email protected]是啥?

那么, [email protected] 究竟是個怎樣的項目?

據中國分布式計算網站介紹,[email protected] 是一個研究蛋白質折疊、誤折、聚合及由此引起的相關疾病的分布式計算工程,由斯坦福大學化學系的潘德小組( Pande Group )主持,于 2000 年 10 月 1 日正式啟動,同時 [email protected] 也是目前世界上最大的分布式計算項目。截止目前有超過百萬人參與項目并提交成果,它的計算能力總和也能達到全球超級計算機 TOP 10 水平。

并且該項目也是 AMD 和 NVIDIA 等 GPU 廠商最早參與推進的分布式計算項目,該項目由于其高密度分子動力學計算原理,對于 CPU、GPU 等硬件的資源消耗是非常明顯的,因此它也幾乎成為芯片性能測試的應用類項目之一。但簡單來說,這就是一臺大型分布式超級計算機,而用戶們可以為此貢獻一個節點。

在研究方向上,[email protected] 專注于精確地模擬蛋白質折疊和錯誤折疊的過程,以便能更好地了解多種疾病的起因和發展,包括阿茲海默癥(腦退化癥)、牛海綿狀腦病(瘋牛癥)、多種癌癥和癌癥相關綜合癥、囊胞性纖維癥。到目前為止,[email protected] 可成功模擬長達 5 秒時段的折疊過程,超出先前估計可模擬的時段數百萬倍。

呼吁更多志愿者加入正是基于此,2 月 27 日,[email protected] 宣布加入新冠病毒研究,以幫助研究人員開發出治療方法。

[email protected] 表示,當病毒表面的蛋白質與肺細胞上的受體蛋白質結合時,肺部感染就發生了。這種病毒蛋白稱為刺突蛋白。由于蛋白質不會停滯,會擺動,折疊和以多種形狀展開呈現,所以我們不僅需要研究病毒刺突蛋白的一種形狀,還需要研究該蛋白擺動、折疊成其他形狀的所有方式,以便更好地了解其與 ACE2 受體是如何相互作用的,從而可以開發出治療抗體。

也就是說,研究人員需要收集刺突蛋白擺動并折疊而成的所有形狀,如果可以研究蛋白質如何折疊,就可以幫助研究人員開發可以治療的藥物。但很顯然,收集需要耗費大量的計算能力,而 [email protected] 則是通過在志愿者閑置時利用其 CPU 來產生的。

而此前,該項目使用的是閑置的索尼 Play Station 3s,其獨特的“核心”處理器在當時的特定任務上比同類電腦提供了更好的性能。但索尼在 2012 年已經將這一功能從 ps3 上移除。


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